Комплексное решение для проведения aCGH-метода сравнительной геномной гибридизации на биочипе

Метод сравнительной геномной гибридизации на биочипе (аCGH – comparative genomic hybridization) позволяет проводить анализ численных и структурных изменений хромосом на геномном уровне. Высокая разрешающая способность аGCH дает возможность получать полную и точную информацию даже при однократном анализе. аCGH является принципиально новым способом получения генетической информации при исследовании хромосом. 

• Постнатальная диагностика задержки развития и умственной отсталости;
• Пренатальная диагностика хромосомных аномалий;
• Преимплантационная диагностика анеуплоидии и микроделеций;
• Геномная «чистота» клеточных линий, например стволовых клеток;
• Молекулярная онкология;
• Изучение вариаций в числе копий ДНК (CNV).

Основы методики aCGH

аCHG обеспечивает анализ хромосомных аномалий на высоком уровне разрешения. Изучаемый образец метится одним флюорофором, а нормальная проба ДНК, представляющая контроль, - другим. Соотношение двух флюорофоров в каждой точке матрицы свидетельствует о наличие или отсутствии амплификации данного хромосомного локуса. аCGH позволяет одновременно проводить тест на все известные трисомии.

Полный цикл проведения методики aCGH

1. Выделение ДНК пациента и контроля
2. ДНК пациента и контроля метится разными флюоресцентными красителями.
3. Эти ДНК наносятся на биочип и затем гибридизуются с пробами, находящимися на биочипе.
4. Слайд (биочип) сканируется на флюоресцентном сканере для получения количественной оценки сигнала флюоресценции, соответствующей количеству ДНК.
5. Сигнал обсчитывается.
6. Результаты визуализируются и интерпретируются с помощью специального программного обеспечения. Представленные результаты – это соотношение количества копий ДНК в тестовом и контрольном образцах для каждой хромосомы.

	Интерпретация результатов исследования методом aCGH в программном обеспечении

• Сканирование целого генома в одном анализе на изменение количества копий ДНК.
• Время анализа – менее чем 2 дня.
• Более высокая разрешающая способность по-сравнению со стандартным кариотипированием.
• Детекция микродупликаций и микроделеций.
• Традиционное кариотипирование и FISH выявляет ~ 10 % случаев детей с умственной отсталостью, тогда как aCGH выявляет еще дополнительных 10 %.
• Для анализа требуется очень малое количество ДНК (в качестве образцов могут быть использованы: кровь, ворсинки хориона, амниотическая жидкость, парафинированная ткань.
• Возможность автоматизации процесса (интеграция в автоматизированную систему пробоподготовки).

	aCGH биочипы и реагенты (для мечения, гибридизации и постгибридизационных отмывок)
	Сканер биочипов ScanRI
	Гибкое и простое в применении программное обеспечение для визуализации результатов, полученных методом aCGH (SpectralWare SW)